După ce descoperise că maladiile infecţioase erau provocate de microorganisme, a apărut ideea introducerii sterilizării, a dezinfecţiilor, a vaccinurilor şi a antibioticelor. El însuşi a descoperit o serie de vaccinuri, inclusiv cel contra rabiei şi antraxului. A creat microorganisme slăbite, ţinându-le la căldură. În această stare nu puteau cauza boala, ci confereau imunitate germenilor pacientului.