Un drum doar dus
Din cauza discursurilor sale anti-naziste a fost arestat, dar eliberat destul de rapid. Arestarea nu l-a făcut să se oprească din a-i proteja pe cei asupriți. Alături de alți preoți, a folosit centrul de editare pentru a ascunde peste 2.000 de refugiați polonezi, majoritatea fiind evrei. Pe 17 februarie 1941, Gestapo l-a arestat, din nou, pentru că au descoperit că Părintele Kolbe adăpostea evrei. Astfel, a fost trimis în închisoare Pawiak din Varșovia, Polonia.
După ce a petrecut trei luni la închisoarea Pawiak, Kolbe a fost transportat în lagărul de concentrare de la Auschwitz, unde a fost identificat ca # 16670. Preotul a fost trimis să lucreze împreună cu alți prizonieri, transportând materiale de construcție pentru crematoriu. Condițiile erau dure iar pedepsele erau destul de frecvente. Totuși, a reușit să-i scrie o scrisoare mamei sale pe 15 iunie: „Totul este bine în privința mea. Stai liniștită pentru că bunul Dumnezeu este peste tot”.
În iulie, un bărbat din cazarma lui Kolbe a reușit să scape. Comandantul lagărului, Karl Fritzsch, a ales 10 bărbați din cazarmă pentru a fi pedepsiți. Unui dintre cei aleși a fost Franciszek Gajowniczek, care a rugat să nu fie luat deoarece avea soție și copii. Kolbe s-a oferit voluntar să-i ia locul lui Gajowniczek și împreună cu alți nouă bărbați, a fost condus la blocul 13.
Pedeapsa acestora a dus la foamete și deshidratare, iar după trei săptămâni, doar patru bărbați au reușit să rămână în viață. Rapoartele spun că Părintele Kolbe i-a condus pe bărbați spre rugăciune. În cele din urmă, pe 14 august, a fost ucis cu o injecție de acid carbolic, o metodă comună de exterminare folosită de naziști, care are ca rezultat decesul instantaneu.
Sfântul Maximilian Kolbe
De-a lungul șederii lui Kolbe în blocul 13, s-a spus că și-a petrecut zilele rugându-se. Nu s-a plâns niciodată de modul în care a fost tratat și le-a zâmbit întotdeauna trupelor SS. Papa Ioan Paul al II-lea l-a canonizat pe Maximilian Kolbe ca sfânt în 1981. În timpul ritului, Papa a spus că Kolbe „nu a murit, ci și-a dat viața pentru fratele său”.
La canonizare au fost prezenți aproximativ 150.000 de oameni, iar unul dintre ei a fost Franciszek Gajowniczek, omul pe care Kolbe l-a salvat. Într-o declarație, acesta a vorbit despre cât de surprins a fost când preotul s-a oferit voluntar să-i ia locul. A spus că niciodată nu a avut șansa să-i mulțumească. „Am fost salvat. Vestea s-a răspândit rapid în toată tabăra. A fost prima și ultima dată când s-a întâmplat un astfel de lucru în toată istoria Auschwitz”, a spus el. Portretele și picturile Sfântului Maximilian Kolbe îl înfățișează adesea în uniforma de închisoare.