Una acuză echipajul că s-a îmbătat, i-a asasinat pe căpitan și familia lui, apoi au fugit de frică, dar am arătat că alcoolul nu era băubil.
A doua: căpitanii de pe Dia Gratia și Mary Celeste sunt mână în mână încă de la plecarea din New York, și s-au înțeles să pună mâna pe partea de marfă ce-i revine descoperitorului epavei. Briggs și-ar fi ucis deci echipajul, înainte de a fi luat la bord de Morehouse și debarcat în Gibraltar. Doar că Briggs, în calitate de co-proprietar al mărfii, ar fi avut mai mult de pierdut.
A treia: Morehouse și echipajul lui au pus mâna pe Mary Celeste și i-ar fi masacrat pe toți cei de la bord. Și așa mai departe…
Ipoteza cea mai plauzibilă a rămas că echipajul a părăsit în mare grabă nava din cauza unei primejdii. Abia au apucat să ia câteva instrumente de navigație înainte de a se înghesui în mica barcă de salvare. O pală de vânt sau un val puternic au răsturnat iola, și toți s-au înecat. Dar ce primejdie i-a speriat în asemenea hal?
Pentru James Winchester, co-proprietar al lui Mary Celeste, varianta cea mai probabilă este teama de o explozie a alcoolului din cală. Este posibil ca vapori de alcool să fi scăpat din butoaie și să se aprindă de la scânteile produse de frecarea cercurilor metalice care strâng butoaiele. De frica unei explozii uriașe, care nu s-a produs, căpitanul ar fi ordonat abandonarea navei.
După o anchetă la Gibraltar, salvatorii corăbiei primesc a șasea parte din valoarea asigurată a încărcăturii, adică 7.700 de dolari (circa 120.000 de dolari astăzi). Mary Celeste este repatriată de proprietari la Boston. Dar ghinioanele nu s-au terminat pentru navă.
Tatăl unuia dintre proprietari se îneacă în timp ce se află la bord. Nava blestemată este vândută imediat. În următorii 13 ani, schimbă 17 proprietari. Ultimul este un anume căpitan Parker, un escroc care vânează asigurări. La 3 ianuarie 1885, el bagă deliberat corabia în recifurile de lângă Haiti și încearcă să dea foc epavei, fără să reușească. Nu se mai găsește nici o urmă din încărcătura de 975 de butoate cu heringi pe care o declarase. Epava sfârșește prin a se scufunda.
În 1884, Arthur Conan Doyle se va inspira din misterul lui Mary Celeste pentru a scrie o nuvelă intitulată J. Habakuk Jephson’s Statement și care a inflamat și mai mult imaginația oamenilor.
